1965-1985-ig a komlói Erkel Ferenc Zeneiskolában zenetanárként működött. 1985-ben Lantos Ferenccel közösen megszervezték az ANK Martyn Ferenc Művészeti Szabadiskolát Pécsett. 1985 óta a pécsi Apáczai Központ Művészeti Iskola, majd 1992-től az ANK Martyn Ferenc Művészeti Szabadiskola Zenei tagozatának vezetője.
1990-1994-ig Budapesten a Liszt Ferenc Zeneművészeti Egyetemen (Zeneakadémia) egy hazai és egy nemzetközi improvizációs kurzust vezetett.
1993-2004-ig a Pécsi Tudományegyetem Művészeti Kar, Zeneművészeti Intézetében, hangszeres improvizációt, zongorát tanított, és komplex művészeti szemináriumot vezetett, szintén Lantos Ferenccel közösen.
1968-tól Lantos Ferenccel kidolgozta a zenei és vizuális művészeti oktatás integrált rendszerét, és ennek részeként tanítványai számára bevezette a zenei improvizáció módszeres oktatását, melyben szerepet kapott a jazz improvizáció is.
1988-ban megszervezte az I. Országos Zeneiskolai Improvizációs Találkozót, majd 1996-ban a II.-, 1999-ben a III. Improvizációs Találkozót.
1998-ban a Művelődési és Közoktatási Minisztérium felkérésére kidolgozta a művészeti-, zeneiskolai IMPROVIZÁCIÓ tantárgy 12 évfolyamra szóló tantervét, amely az 1998-99-es tanévtől kezdve bevezetésre került.
1977-től a Pécsváradi Művészeti Műhelyt, 1979-től a Komlói Művészeti Műhelyt vezette egészen 1985-ig. 1975-től számos előadást, bemutatót és továbbképzést tartott az integrált művészeti nevelésről, többségében Lantos Ferenccel közösen, az ország különböző városaiban és külföldön. (1980 ISME, 1985, 1986 Varsó, 1982 Remscheid, 1987 Utrecht, Magyar-Holland Kulturális Hét, 1988 Ungvár, 1989, 1990 ISME, Helsinki, 2004. Jaročin, 2004 SYMMETRY: ART AND SCIENCE TIHANY CONGRESS –lecture with organ concert)
Előadások tartása:
- 2014. okt. 8. – okt. 22. – nov. 5. – nov. 26. előadás-sorozat:
- Budapest, Bartók Emlékház (MŰVÉSZETI OKTATÁS – EMBERNEVELÉS; Természet-Rend-Alkotás-Művészet)
- 2015. jún. 16. előadás:
- Budapest, Magyar Tudományos Akadémia (A művészet és a művészetoktatás hatása az emberi életre)
- 2015. szept. 16. – okt. 8. – nov. 11. előadás-sorozat:
- Budapest, Bartók Emlékház (IMPROVIZÁLJUNK EGYÜTT)
- 2015. szept. 26. előadás:
- Magyar Művészeti Akadémia (Zene és vizualitás kapcsolata az oktatásban)
- 2015. okt. 16. – 2016. jan. 22. – márc. 18. – ápr. 29. előadás-sorozat:
- Keszthely, Életfa Általános és Alapfokú Művészeti Iskola (MŰVÉSZETI OKTATÁS – EMBERNEVELÉS; Természet-Rend-Alkotás-Művészet)
- 2016. szept. 21. – okt.12. – nov. 16. – dec. 1. előadás-sorozat:
- Budapest, Bartók Emlékház (ISMERJÜK MEG BARTÓK ZENEI NYELVEZETÉT)
- 2016. őszétől a Pécsi Tudományegyetemen Improvizáció tantárgyat tanít
- 2017. február 13.
- Szegedi Tudományegyetem Zeneművészeti Kar, (Az improvizáció szerepe a zenei képzésben)
- 2017. február 22.
- Érd, Lukin László AMI (Apagyi Mária: Zongorálom – Kreatív zongoratanulás)
Számos improvizációs mesterkurzus vezetése is a nevéhez fűződik:
- 1984. Debrecen, zenetanárok részére. A vizuális programot Lantos Ferenc vezette
- 1985 és 1987. Orosháza, kiemelkedő növendékek részére szervezett nyári táborban
- 1986-87. Budapest, zenetanárok részére, havi egy alkalom
- 1986. Varsó, Chopin Zeneakadémia
- 1988. Ungvár, zeneművészeti szakközépiskolások részére
- 1990. Szeged, zenetanárképzősök részére
- 1990-1994 Budapest, Liszt Ferenc Zeneművészeti Egyetem
- 2000-2002 Budapest, Improvizáció tanítás Király Csaba International Piano Master Class kurzusán
- 2003 és 2005. Róma, Római Magyar Akadémián a római zeneakadémisták részére
A fenti tevékenységek mellett még nyári táborok vezetését is végezte:
- 1981-1997. Paks, Pécs, Almamellék, Lantos Ferenccel közösen
- 1988. Tatabánya, Nemzetközi Jazz táborban
- 1997. Tatabánya, Lantos Ferenccel közösen, Nemzetközi Jazz táborban)
- 1996-2000-ig a ZETA (Zenetanárok Társasága) Komplex Művészeti Szekciójának vezetője (Lantos Ferenccel közösen)
Apagyi Mária 1991-től rendszeresen kamarazenei és szóló zongora és orgonakoncerteken szerepel.